对于类风湿关节炎（RA）的病因尚处于探索阶段。

研究发现，RA 可能与自身免疫、遗传、感染、吸烟等因素有关，但寒冷、潮湿的环境暴露与 RA 发病无显著相关。

基本病因

自身免疫

患者的免疫系统错误地将自身正常的关节组织当作威胁，并对其进行攻击，导致软骨、滑膜、韧带和肌腱等组织发生一系列的炎症反应。

遗传

RA 有家族聚集特征，由此与遗传存在密切关联。目前研究显示，RA 的遗传易感性与人类白细胞抗原（HLA）基因密切相关，包括 DRB1*0401、DRB1*0404、DRB1*0405 等数百个等位基因位点，但是它们在不同种族中对疾病发生的影响力并不相同。

新近研究发现，HLA-DQα1: 160D 是我国汉族 RA 强相关遗传风险因素，其易感风险高于已知的易感基因 HLA-DRB1。携带 RA 易感基因的个体罹患 RA 的可能性增高，但并不代表必然患病。

诱发因素

微生物感染

微生物感染是 RA 发病的关键诱因，其中牙龈卟啉单胞菌、普雷沃菌属、奇异变形杆菌、EB 病毒、巨细胞病毒、人乳头瘤病毒、疱疹病毒等多种病原体感染与疾病发生相关。