甲状腺癌的治疗方法主要分为外科治疗和放射性碘治疗两大类。

外科治疗主要针对可疑为癌的甲状腺结节和已确诊的甲状腺癌。对于可疑的甲状腺结节，如果存在不除外癌性结节、直径大于1cm的囊性结节或穿刺检查找到癌细胞等情况，应尽早进行手术治疗。对于甲状腺单发实性结节、囊实性结节及囊性结节＞1cm者，常规进行患侧腺叶切除加峡部切除术，术中未发现淋巴结肿大者不给颈清术。

对于已确诊为甲状腺癌的患者，治疗方案的选择取决于患者的体质情况、癌肿的病理类型和临床分期。乳头状癌的恶性程度较低，颈淋巴结转移率高，好发于中青年妇女，因此手术治疗必须考虑以上因素。如果癌肿局限在一侧的腺体内，可将患侧腺体连同峡部全部切除，同时行对侧腺体大部切除；如果癌肿已侵及左右两叶，则需将两侧腺体连同峡部全部切除。手术后5年治愈率可达90%以上。滤泡状腺癌的转移方式主要是血道转移，淋巴结转移约占60%，临床上无颈部淋巴结肿大者一般不作预防性颈清扫术。髓样癌的恶性程度中等，常沿淋巴道及血道转移，一旦颈部淋巴结转移即可较快浸润到包膜外，累及周围组织，因此确诊后不管临床能否扪及肿大淋巴结，都应做选择性颈淋巴结清扫术。未分化癌的病程短，进展快，首诊时大多数已失去治疗机会，预后恶劣，不宜手术治疗或仅能做活检以明确诊断，但偶尔有病灶较小适宜手术的，还应积极争取作治疗性手术。

放射性碘治疗主要用于甲状腺乳头状癌和滤泡癌的治疗。对于甲状腺滤泡状癌和乳头状癌，当前国内外公认的最好治疗方法是：甲状腺全切或近全切+放射性碘131治疗+甲状腺激素抑制治疗。不同的治疗方案有不同的治疗效果，综合治疗是最佳选择。甲状腺全切或近全切、甲状腺全切或近全切+甲状腺激素抑制治疗、甲状腺全切或近全切+放射性碘131治疗+甲状腺激素抑制治疗复发的危险分别为34%、11%、2.7%。