打完AC群流脑疫苗发烧主要是因疫苗具有一定病毒活性，进入人体后干扰体温调节中枢所致。AC群流脑疫苗是用于预防A群和C群的流行性脑脊髓膜炎的疫苗，因该疫苗是一种减毒活疫苗（即病原体经处理后，发生变异，毒性减弱，但保留其免疫原性），进入人体后会干扰体温调节中枢，从而使接种者在接种完AC群流脑疫苗后出现发烧。因个体差异大，发烧时长因人而异，一般情况下，发烧会持续1~2天，然后自行退热。但若体温长时间不降，可能是有其他原因所致，需及时到医院进行相关检查，并遵医嘱采取针对性治疗。