首先，针对泌尿系感染，需要使用四联疗法进行治疗，并注意口腔卫生和定期消毒碗筷。对于肺气肿，要改善呼吸功能和预防感染，使用支气管扩张剂和适当的抗生素。同时，建议戒烟。肾囊肿3公分不需要手术，定期复查即可。结石的治疗可以选择体外冲击波碎石或输尿管软镜手术。最后，注意休息，饮食清淡，多吃水果蔬菜，避免辛辣刺激的食物和饮酒。