自体脂肪移植作为取材容易，经济实惠，没有排异反应等优点，广泛应用于颜面、乳房，私密等各部位组织的填充中。但实施自体脂肪移植手术也还是存在相应并发症的。

1.脂肪液化吸收：以目前的技术水平，即使是按规范操作也几乎所有人移植后都会不同程度的发生移植脂肪液化吸收问题，使移植时的组织饱满程度大打折扣，通常吸收率可达到 50-80%。而且经过临床试验，如果单纯一次性加大移植量，也并不能减少吸收率(有的甚至会使吸收率更大)。

2.移植的脂肪形成结节，钙化：为保证移植后的脂肪存活，通常都是采用多点、多线和多平面移植(以利移植脂肪于周围组织更多接触面提供血运)，都会在移植脂肪外周形成包膜，故会形成大小不等的结节，有的结节时间久了会形成"钙化"样结节。

3.皮肤不平整：由于移植部位不能完全保证吸收率一样，故可能发生不平整现象。

4.血肿、感染：移植时有可能损伤移植部位血管造成血肿或感染发生。

5.移植部位色素沉着：移植后可能造成局部皮肤色素性改变造成色素沉着。

6.感觉迟钝：可能由于移植时局部皮肤感觉神经受到损伤，使个别者移植部位的皮肤感觉变得迟钝。