安徽医科大学附属巢湖医院坐落在美丽的巢湖之滨，前身是中国人民解放军皖南军区陆军医院，1951年9月10日成立于芜湖市。1952年6月，奉命迁移至肥西张新圩，同年8月集体转业并移交省卫生厅，更名为安徽省第四康复医院。1954年3月迁到巢湖市现址。1960年7月，医院更名为安徽省立巢湖医院。1969年，安徽省设立巢湖地区，医院更名为巢湖地区人民医院。2000年，巢湖撤地设市，医院更名为巢湖市第一人民医院。2005年成为安徽医科大学第六临床学院。2006年3月被评为三级甲等医院。2012年12月，医院被省政府批准为安徽医科大学直属附属医院。2013年1月，医院正式移交安徽医科大学管理，更名为安徽医科大学附属巢湖医院。2014年9月，安徽医科大学实行临床学院与附属医院“院院合一”，医院同时为“安徽医科大学巢湖临床医学院”，学院下设全科医学系。2017年7月，安徽省卫计委将“安徽省精神医学中心”挂靠在安徽医科大学附属巢湖医院。经过72年的建设和发展，已成为一家集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等功能为一体的三级甲等省管综合性医院。医院占地面积16.72万平方米，业务用房面积14.59万平方米。现有开放床位1433张，临床科室38个，病区44个，医技科室13个，教研室38个。年门诊量90余万人次，年收治住院病人5.4万人次，手术近2万台次。医院拥有256排和64排螺旋CT、大孔径CT，1.5T核磁共振、3.0T超导型核磁共振，医用直线加速器（ElektaInfinity）、心肺辅助系统（ECMO）、数字减影血管造影成像系统（DSA）、双板数字摄影系统（DR），全自动血细胞分析流水线，全自动生化分析流水线，全自动生物质谱检测系统，磁刺激治疗系统，高端四维彩色多普勒超声诊断系统，超声眼科晶状体摘除和玻璃体切除设备，心脏体外循环系统，弹道碎石系统，超高清3D腹腔镜系统等大型医用设备，总价值约3.16亿元。医院全面实施创新兴院、人才强院、质量立院三大战略，注重医疗、教学、科研建设。现有职工1762人，高级职称272人（其中正高60人），安徽省江淮名医2人，国家级医学专业委员会主任委员1人，省级以上学会主任委员10人，副主任委员40人。科研顾问1人，特聘科研教授5人，特聘专家3人，博士生导师9人，硕士生导师60人。医院现有省临床重点专科5个，国家住院医师规范化培训基地专业基地13个；医院近5年获国家自然科学基金8项，省级科研项目45项，省科技进步二等奖1项、三等奖1项，实用性发明专利13项，安徽省卫生适宜技术推广项目2项，发表SCI论文213篇、中文核心期刊论文205篇。医院始终秉承“博极医源、精勤不倦”的院训，坚持“救死扶伤、济世康民”的办院宗旨，不断改善服务质量，提高患者满意度，着力建成高水平、有特色的医科大学附属医院，赢得了社会各界的广泛赞誉。
