哈尔滨市第六医院是哈尔滨市属承担收治法定传染病（除结核病外）病人和处理突发公共卫生事件的三级甲等专科医院，是黑龙江省传染病防治中心和黑龙江省哈尔滨艾滋病、性传播疾病治疗中心。医院始建于1946年，医院占地面积4万平米，建筑面积2.3万平米，医疗用房面积1.9万平米，编办核定职工人数364人，在职职工388人，其中专业技术人员占85%。批复编制床位550张，开放床位338张。医院承担传染病疫情的应对和管理、全市艾滋病人的免费治疗与管理、传染病医疗救治服务网络建设职能。属公益类事业单位。医院设有肝炎门诊、呼吸道门诊、肠道门诊（手足口）、肿瘤门诊、肾内门诊、外科门诊、母婴阻断门诊、皮肤性病门诊、艾滋病门诊、中西医结合门诊、心内科门诊11个门诊及九个病区，是全省规模大、具有应对突发公共卫生事件的三级甲等专科医院。。
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