黑龙江省中医药科学院的前身是成立于1957年的黑龙江省祖国医药研究所（俗称“祖研”），1995年加挂“黑龙江省中医医院”牌匾，是黑龙江省中医药管理局直属的集科研、医疗和研究生教育为一体的综合性中医药研究机构。随着规模的发展和功能的不断健全，2013年我院正式更名为黑龙江省中医药科学院。黑龙江省中医药科学院学科齐全，科研力量雄厚，下设5个研究所、1个医疗机构、1个研究生院、2个杂志社（《中国中医药科技》、《黑龙江省中医药》），1个社区卫生服务中心，1个国家中药剂型改革基地和25个专病教研室。我院现有员工1503人，卫生专业技术人员1277人，具有正、副高级职称专家427人，其中享受省政府和国务院特贴专家28人，省级名中医34人，拥有全国名中医张佩青教授、名中医王铁良教授等一大批优秀中医药人才。2020年国家权威中医药学术机构首次评估《基于中医特色优势与科技影响力评价100所中医医院》我院排名17位，2021年4月发布的“全国三级公立中医医院绩效考核”我院排名全国13位，全省第一位，综合实力居于全国同行业前列，我院先后三次荣获“全国卫生系统先进集体”荣誉称号，并被省委、省政府评为推进“八大经济区”和“十大工程”建设先进单位荣誉称号、被授予“贡献奖”，是全省卫生系统唯一受表彰单位，2021年被授予“省直文明单位”荣誉称号。中医药科学研究是黑龙江省中医药科学院的主要任务，现拥有国家中医药科研三级实验室5个，省级领军人才梯队12个和省头雁团队。我院还下设中医基础理论研究所、针灸研究所、中医临床研究所、中西医结合研究所和中药所5个研究所。建院以来，共取得科研成果409项，获得部省级以上科技奖励123项，研制出“刺五加”、“满山红”、“双黄连粉针”等具有里程碑意义的名牌产品和“宁神灵”、“骨筋丹”、“丹王颗粒”、“葛根芩连微丸”、“芩百清肺浓缩丸”等具有自主知识产权的中药新产品47个，已开发医院制剂62个，并承担了全省大部分中药医院制剂的委托开发。近年来，为适应大健康产业发展的需求，充分发挥大豆、玉米须等龙江农副产品、药食同源的北药、林下真菌及林果资源优势，中药所研发了具有辅助降血脂、预防血栓、降血糖、改善便秘、补钙、改善女性更年期症状、预防酒精性肝损伤等60余款保健食品及药食同源食品，开发了一批大健康日化产品投放市场。我院还投资建立了我省唯一一个符合GMP标准的现代化中药制剂中心，能够生产膏方、胶囊、颗粒剂、片剂、口服液、等十余种剂型，同时，还承担着黑龙江省中药制剂中试基地、黑龙江省中药剂型改革重点实验室和国家中药剂型改革基地的中试生产及科研工作，为我省中药制剂产业发展提供了有力的科技支撑。黑龙江省中医药科学院充分发挥中医药特色优势，积极为广大患者提供良好的医疗服务。我院拥有国家区域中医诊疗中心2个，国家中医药临床重点专科4个，国家中医药重点学科和重点专科16个。我院下设的医疗机构黑龙江省中医医院是三级甲等医院，现建筑面积13万平方米，分为三辅、香安、南岗3个院区，医疗床位1808张，在肾病、脑病、心病、皮肤病、肺病、内分泌、肝胆脾胃病、肿瘤等疾病的中医及中西医结合治疗方面，具有丰富的经验和独特的疗效，在国内有较高的声誉。2021年，争取到了国家中医疫病防治基地建设项目，同时依托学府院区、省机关事务管理局、省公务员小区和长江路的干部保健诊室，建立起黑龙江省慢病防治平台，增设了学府院区和海南分院，不断发挥中医药特色优势，服务功能更加完善，服务范围不断拓展。黑龙江省中医药科学院是培养中医药高层次人才的重要基地，为中医药行业培养了大批优秀中医药人才。我院设有研究生院，有中医学、中西医结合、中药学3个硕士一级学科学位授予权与博士后科研工作站，现有在校研究生512人。拥有全国名老中医传承工作室9个，现正培养第七批学术继承人，加强对“祖研医派”学术思想和诊疗经验的整理，建立了学术传承、研究、推广应用新模式。我院中医药老专家医学著作馆藏正在筹建中。作为我省传统中医药的领军团队，我院充分发挥引领和辐射作用，坚持“博精仁和”的祖研精神，以中医为主的发展方向，明确了“祖研大、大祖研”和“集团化管理、精品化学科、创新化研究、特色化教育、网格化责任”的发展战略，狠抓发挥中医药特色优势和提高中医临床疗效，更好地满足人民群众对中医药的需求，为我省中医药事业作出新的更大的贡献。。
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