医院现有临床医技科室53个。有国家临床重点专科（过敏反应科）、国家临床重点专科能力建设项目（医学检验科）、国家神经系统疾病临床医学研究中心重庆分中心、重庆市临床检验中心，以及重庆市骨伤骨病医疗中心、重庆市甲状腺结节与甲状腺癌专病临床诊疗中心，重庆市肺结节与早期肺癌专病区域临床诊疗中心，重庆市脑胶质瘤精准医学研究中心。拥有重庆市医学重点学科6个（心血管外科学、骨科学、老年病学、耳鼻咽喉学、医学检验学、呼吸病学），重庆市临床重点专科16个（重症医学科、医学检验科、麻醉科、呼吸与危重症医学科、骨科、老年病科、医学影像科、神经外科、消化内科、神经内科、心血管内科、普通外科、心胸外科、肿瘤科、耳鼻咽喉科、妇产科），市级医疗特色专科1个（康复医学科），市级首批公共卫生重点专科（学科）建设项目1个（眼科近视防治），市级临床医学研究中心4个（心血管外科学、检验医学、耳鼻咽喉疾病、老年疾病），市级重点实验室2个（神经变性病重庆市重点实验室、肝胆胰疾病智慧诊疗工程重庆市重点实验室），市级研究所3个（重庆市心肺血管疾病医疗研究所、重庆市老年病防治研究所、重庆市老年慢性疾病研究所），市级研究室2个（重庆市肾脏病透析治疗研究室、重庆市临床检验质量控制研究室）。医院现有编制床位2000张，职工2540人，其中专业技术人员2245人，高级职称420人，博士110人，拥有一批双聘院士、长江学者特聘教授、中华医学会现任主任委员、教育部“长江学者创新团队与发展计划”带头人、国务院政府特殊津贴专家及重庆市突出贡献专家、市级学术技术带头人、重庆英才；是国家级博士后科研工作站、国家住院医师规范化培训基地（17个专业）、国家临床药师规范化培训基地、国家药物及医疗器械临床试验机构、重庆市护士规范化培训基地、重庆市专科护士培训基地（耳鼻咽喉、健康管理）。拥有一批博士生导师和硕士生导师，在读博士生46名，硕士生142名。心理，。