盱眙县中医院创建于1986年，是一所集医、教、研、中西医结合于一体、服务功能健全的二级甲等中医院，目前成为南京中医药大学教学医院，并与东南大学附属中大医院合作医院、江苏省中医院、江苏省人民医院、南京鼓楼医院、南京军区总医院、南京市二院等多家大型医院建立了广泛的合作关系。先后被授予省、市卫生系统先进集体，江苏省“爱婴医院”，淮安市文明单位，淮安市质量诚信单位等荣誉称号，是盱眙县城镇职工医疗保险和农村合作医疗定点医院。医院现有职工510人，其中专业技术人员占85％，副主任医师以上职称的医疗专家32位，硕士研究生9名，博士1名。开设临床和医技科室25个，专科、专病门诊15个，编制病床280张，实际开放450张。23层综合大楼以于2010年初封顶，计划在本年年底投入使用，届时该院将设定床位800张，设立血透中心、肿瘤治疗中心、康复中心、体检中心、微创中心等，为即将创建三级医院、南京中医药大学附属医院积极准备。医院设立十个病区，心内科、呼吸内科、消化内科、肝胆外科、微创外科、肿瘤外科、脑外科、胸心外科、泌尿外科、骨伤科、中医妇科、儿科、眼科、耳鼻喉科、针灸推拿科、肛肠科等科室在县内外具有领先水平和较高声望。 医院拥有磁共振、螺旋CT机（2台）（其中Philips16排螺旋CT是国内较为先进的多排螺旋CT机，该设备目前在苏北县级中医院尚属首台）、DR（2台）、彩超、C型臂X光机、腹腔镜、电子胃肠镜、全自动生化分析仪、高压氧舱、血透机（12台）、心电工作站、纤维支气管镜、纤维胆道镜、肺功能测定仪、膀胱镜、输尿管镜、前列腺气化电切镜、气压弹道碎石机、宫腔镜等一大批国内外先进医疗设备并投入使用，极大地满足了临床需求，提升了诊疗水平。
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