庆云县中医院为二级中医医疗机构，建筑面积4.3万平方米，包括门诊病房综合楼、住院楼、影像楼、餐饮楼、介入手术室、消毒供应室、静脉用药集中调配科等功能区域；现有职工150人，其中医疗技术人员110人，床位200张。设有内科、外科、妇科、儿科、针灸推拿科、治未病科、康复医学科、口腔科、肛肠科、急诊科、麻醉科、医学影像科、医学检验科等医疗医技科室；医疗设备有1.5T西门子磁共振、64排CT、DSA、西门子及迈瑞彩超、纤维胃肠镜、日立800速生化分析仪、DR（包括移动DR）、中医CT、四诊仪、冲击波等辅助设备和超声波治疗仪、智能关节康复期、减重步态康复平台、康复床、离子导入仪、电脑恒温电蜡疗仪、颈腰椎治疗多功能牵引床、多关节主被动训练仪等康复理疗设备。庆云县中医院现为“山东中医药大学临床实践教学基地”、“山东省中医妇科专科联盟成员单位”、“山东第一医科大学附属颈肩腰腿痛医院合作医院”、“省会经济圈‘1+6’中医药一体化发展联盟”成员单位、“济南市中医医院对口帮扶单位”。建设有国医大师李佃贵传承工作室、泰山学者师彬工作室和山东省名中医刘政工作室等中医药名家工作室，邀请多名中医药专家长期在我院坐诊。。