百日咳，又称Whooping Cough或pertussis，是一种由百日咳嗜血杆菌引起的急性呼吸道传染病。其特征是阵发性痉挛性咳嗽，咳嗽末尾常伴有鸡鸣样吸气性吼声。这种疾病主要影响儿童，咳嗽症状可能持续2到3个月，因此得名。百日咳杆菌是一种革兰阴性短杆菌，需要含有血液的培养基才能生长，其抗原结构复杂，能产生多种毒素物质。该菌对外界抵抗力弱，容易被消毒剂和紫外线消灭。百日咳杆菌通过呼吸道侵入人体，粘附于呼吸道上皮细胞纤毛上，繁殖并产生毒素，导致呼吸道上皮细胞纤毛麻痹和细胞坏死，从而引发剧烈的咳嗽症状。百日咳的传染源是病人，传染期通常在发病后的1到3周，尤其第1周传染性最强。通过飞沫传播，婴幼儿尤其易感，病后可获得持久免疫力。

百日咳杆菌为革兰阴性染色的短杆菌，需氧，无鞭毛及芽胞，需要含有血液的培养基才能生长。该菌抗原结构极其复杂，能产生多种毒素物质。百日咳杆菌侵入易感者呼吸道后，粘附于呼吸道上皮细胞纤毛上，繁殖并产生毒素而致病。细菌产生的毒性物质淋巴细胞促进因子进入血流，使脾、胸腺及淋巴结释放出大量淋巴细胞，致血白细胞数和淋巴细胞分类增高；外毒素使呼吸道上皮细胞纤毛麻痹和细胞坏死，呼吸道产生粘稠的分泌物并排出受阻，潴留的分泌物不断刺激呼吸道神经末梢，通过咳嗽中枢引起痉咳；痉咳时患儿处于呼气状态，同时声门痉挛，痉咳停止时吸入大量气体快速通过痉挛的声门出现高调鸡鸣样吼声；长期痉咳使咳嗽中枢形成“优势兴奋灶”，致使患儿在受到其他刺激时，甚至病愈后一段时间亦可因上感而诱发痉咳。