随着抗生素的广泛使用，日本学者Okazaki于本世纪初首次分离出了肺炎支原体耐药菌株，引起了学界高度关注，此后越来越多的相关文献报道耐药呈快速增加趋势，快速增长的肺炎支原体耐药率和缓慢的抗生素研发应用使人类的健康面临严重威胁。
相对其他病原体而言，肺炎支原体分离培养更加困难，耐药研究专业性更强。

在东亚国家和地区，耐药情况尤其严重。

韩国2011年9月到12月发生肺炎支原体感染流行，其儿童耐大环内酯类肺炎支原体的检出率达到61.3％；日本2000—2006 年耐药率从0上升至30.6%。

日本2009年和2011年均报道了肺炎支原体所导致的儿童呼吸道感染的暴发，耐大环内酯类肺炎支原体的检出率超过了80％。香港和台湾也有陆续的类似报道。

欧美多个国家同样有检出耐大环内酯类抗生素的肺炎支原体菌株的报道，欧洲部分地区的耐药率最高达到了26%，但与亚洲国家相比，一些欧美国家的类似研究结果虽然提示耐大环内酯类肺炎支原体的检出率有增加的趋势，但总体仍较低。

Dumke 等报道的1991-2009年德国成年患者中耐大环内酯类肺炎支原体占所分离出的肺炎支原体比例仅为3％。法国波尔多和卡昂两个城市2011年耐大环内酯类的肺炎支原体发生率达8.3％。

意大利2010年肺炎支原体感染暴发，住院43例患儿中11例(26％)感染的是耐大环内酯类抗生素的肺炎支原体。

在美国，Wolff等报道的1991--2008年美国的耐药比例为5％，Yang 等报道的耐药率为13.2%，圣路易斯2007—2008年耐大环内酯类肺炎支原体的检出率为3.3％；2009～2010升至了15.8％。

我国耐药形势最为严重，耐药率大大高于欧美等国。

国内文献报道，我国肺炎支原体对大环内酯类药物的耐药率为69％一95％，而我国北京及上海先后报道肺炎支原体对大环内酯类药物耐药率超过90％。北京朝阳医院179例CAP中确诊支原体肺炎的患儿83例(46％)，其中肺炎支原体培养阳性45例，其中44株体外药敏试验结果显示对大环内酯类药物高度耐药，耐药率高达98％(44／45)。不仅如此，我国肺炎支原体耐药率增加非常快，Zhao等报道，2008—2012年北京耐大环内酯类肺炎支原体的检出率由68.9％升至90％以上，最高达98.4％。