为什么在口服避孕药与 HPV 感染风险的关系的研究会出现不同甚至相反的结果呢？主要是因为 HPV 感染风险的影响因素有很多，分析时需要控制其它因素的影响。

就避孕方式而言，使用口服避孕药的人群极少会再使用避孕套?因此会增加 HPV 的暴露风险；而不使用口服避孕药的人群中很可能会使用避孕套（当然也有部分人会使用宫内节育器等方式避孕）。不过，上面列举的两个研究，在分析时将一些已知的影响因素进行校正后，使用口服避孕药者的风险仍然是增加的。

Winer（2003）认为使用口服避孕药可能代表了在研究中没有控制的某些性行为（混杂因素），口服避孕药不一定直接对 HPV 感染产生影响【7】。