肺部空洞的诊断需要结合临床症状、体格检查和辅助检查。首先，通过询问病史和体格检查可以初步判断可能的病因。例如，肺内空洞伴随咳嗽、咳痰、咯血可能是肺结核空洞、支气管扩张、肺癌空洞或肺曲菌病等；肺内空洞伴随咳嗽、咯大量脓性痰可能是肺脓肿、支气管扩张或肺囊肿等；肺内空洞伴随咳嗽、咳痰、畏寒、发热可能是肺脓肿、肺结核、支气管扩张并感染、真菌感染或金黄色葡萄球菌肺炎等；肺内空洞伴随咳嗽、咳痰、全身多脏器病变可能是类风湿性肺病、韦格纳肉芽肿等；肺内空洞伴随职业病史或生活环境中有寄生虫病接触史可能是硅沉着病空洞、肺棘球蚴病囊肿或卫氏并殖吸虫病等。

其次，辅助检查也是必不可少的。实验室检查包括血液检查、痰液检查和结核菌素试验等；支气管镜检查可以直接观察气管和支气管内的病变；病理学检查是确诊的主要手段；剖胸探查对于高度怀疑肺癌的病例也是一种有效的诊断方法。

最后，鉴别诊断也非常重要。肺感染性疾病如结核性空洞、肺脓肿和曲菌性肺空洞等都需要与其他疾病进行鉴别；癌性空洞如肺癌空洞和肺转移瘤等也需要与其他肿瘤性空洞进行鉴别；此外，肺梗死空洞、硅沉着病空洞和结缔组织病和风湿性疾病引起的空洞也需要进行鉴别诊断。