桥本甲状腺炎是一种自身免疫性疾病，益生菌对病情本身的治疗效果有限，但可辅助改善肠道健康。建议在医生指导下选择适合的益生菌，注意不要长期过量服用。对于儿童益生菌，应选择适合儿童使用的产品，并在医生建议下使用。同时，适当限制碘的摄入，如减少海带、紫菜等食物的摄入。