低血糖的病因多种多样，糖的摄入不足、生成不足、消耗过多、转化过多等原因均可导致血糖下降。

按临床分类

器质性：存在明确病因，如胰岛素过多（胰岛素瘤或胰岛β细胞增生）、肝病（糖原生成和分解障碍）、内分泌疾病（肾上腺糖皮质激素不足）、自身免疫性低血糖症（抗体阻碍胰岛素降解）、先天性酶缺陷（糖原积累症、儿童严重低血糖）等，造成体内糖量减少。

功能性：进食后胰岛β细胞受刺激分泌胰岛素过多，如反应性低血糖、倾倒综合征（胃大部切除后）等。

外源性：多与糖尿病相关，如降糖药（胰岛素促泌剂）与胰岛素过量，或是治疗过程进食量明显减少，从而导致低血糖。