根据您的描述，肩膀酸痛和膝盖酸疼可能与手术和用药无关，可能是由于体内钙离子紊乱、骨关节劳损、风湿性或类风湿性关节炎等原因引起的。建议您继续休息观察，局部可以适度按摩和热敷，外用扶他林抗炎镇痛尝试缓解。同时，需要化验血钙、甲状旁腺激素和骨密度确认是否存在钙离子紊乱，拍摄局部x光、CT或核磁，必要时进行核素骨扫描检查是否有骨转移。