新疆医科大学第一附属医院昌吉分院，前身为昌吉市第二人民医院，是一所非营利性综合性二级甲等医院。医院在2014年12月与新疆医科大学第一附属医院签署托管合作框架协议，实现了跨越式发展。昌吉分院占地面积138亩，建筑总面积8.8万平方米，核定床位800张，实际开放床位573张，内设26个临床科室，7个医技科室，10个职能大部，1个健康管理中心。 其中，心血管内科专业、骨科专业和肝胆专业是医院的市级重点学科，医院还设有州级高层次人才工作室、市级高层次人才工作室以及州级重点人才项目。在学科发展中，昌吉分院充分发挥新疆医科大学第一附属医院的学科优势，重视心血管内科、骨科等基础学科的梯队建设，强化妇科、产科、儿科的一体化发展，突出微创外科、介入治疗、皮肤科等特色诊疗。 医院拥有一批具有国际先进水平的高精尖设备，如口腔CT、大宝石CT等，实现了全院内部联网，门诊就诊“一卡通”，基本实现医院办公自动化。在管理上，昌吉分院大胆创新，临床、医技科室采取病区式管理，行政、职能采取大部制管理。医院拥有雄厚的人才梯队支撑，与一附院共享“人才金字塔”库。 医院竭力为患者提供便捷、高效的医疗服务，为昌吉分院患者开通“转诊绿色通道”，保证疑难危重患者能享有第一时间的高效救治。借助一附院本部远程医学优势，为分院患者开辟远程诊疗绿色通道，使当地百姓足不出户即可享受省级知名医院和国内知名医院专家的会诊。 新疆医科大学第一附属医院昌吉分院将继续努力，构建“生态医院”，不断改善、优化患者就医环境，为患者提供价廉、优质的医疗服务，实现“属地诊疗、正确转诊、疑难危重少出疆”的工作目标。医院将以基本医疗服务与高端医疗服务兼有，特色医疗与健康服务并举，大专科、小综合、强基本、创品牌，努力建设成中亚有较大影响的新型医院。例如，心血管内科、骨科等科室在诊疗技术和服务质量上不断提升，赢得了广大患者的信赖和好评。。
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