东垣众多明方如补中益气汤、补脾胃泻阴火升阳汤、升阳益胃汤、通气防风汤、黄芪人参汤等无不以甘温健脾为中心，其中属补中益气汤最为代表。补中益气汤首列黄芪、人参、甘草三味药，他认为“以上三位，除湿热烦热之圣药也”，此三味药为甘温益气之上品，为东垣甘温健脾最常用，能益元气以泻火邪也。补中益气汤另有甘温之当归身活血补血，东垣在《脾胃论》中论述:“夫脾胃不足，皆为血病……诸阳气根于阴血中，阴血受火邪则阴盛，阴盛则上乘阳分，而阳道不行，无生发升腾之气也。”

脾胃为气血生化之源，脾胃亏虚则气血生化乏源，伍用当归可气血同补。又血为气之帅，血可生气亦可载气，配当归可奏活血化瘀行气之效。脾为太阴湿土，主运化，脾气亏虚不能运化水湿，遂脾虚往往与湿邪内胜相伴，湿邪又反困脾土，故治疗阴火化湿也很重要。

对于湿邪，东垣认为“用淡渗之剂以除之，病虽即己，是降之又降，是复益其阴而重竭其阳”，“若渗泄淡味，皆为滋阴之味，为大禁也”，故治疗湿邪，东垣提出“必用升阳风药即差”，如用薏苡仁、茯苓等淡渗之剂势必配伍风药以防清阳下陷。