症状和病史不能作为诊断标准，只能帮助筛选疑似食物过敏 。 综合实验室指标和症状，精准诊断 。 诊断性食物回避 2-6 周 + 激发试验 ( 诊断金标准 )  。 激发前严格回避可疑致敏食物 2-6 周， IgE 介导： 2-4 周 ， 非 IgE 介导 ：可长达 6 周 。

对于疑似非IgE介导的牛奶蛋白过敏，建议饮食回避期间使用 AAF 替代 ， 如经氨基酸配方奶喂养4 ～ 6 周后症状无改善，则排除牛奶蛋白过敏，恢复饮食；而如症状有明显改善，则需经开放性食物激发试验进一步确诊。如开放性食物激发试验阴性，则排除牛奶蛋白过敏，恢复饮食；而如开放性食物激发试验阳性，则确诊为牛奶蛋白过敏，需要继续回避牛奶蛋白，给予氨基酸配方奶或深度水解配方奶喂养。

对于疑似IgE介导的牛奶蛋白过敏，可以行皮肤点刺试验或血清特异性IgE检测。对于母乳喂养婴儿，母亲应严格回避牛奶蛋白，同时继续母乳喂养；而对于配方奶喂养婴儿，应给予氨基酸配方奶喂养。经限制牛奶蛋白2~4周后，如婴儿症状无改善，则排除牛奶蛋白过敏，恢复饮食；而如婴儿症状有明显改善，则大致肯定牛奶蛋白过敏，需要进一步行开放性食物激发试验。如食物激发试验阴性，则排除牛奶蛋白过敏，恢复饮食；而如食物激发试验阳性，则确诊为牛奶蛋白过敏，需要继续回避牛奶蛋白，给予氨基酸配方奶或深度水解配方奶喂养。

诊断性食物回避使用 eHF ，可能造成误诊漏诊，近 30% 的过敏患儿不耐受 eHF ，即使是轻中度患儿也可能对 eHF 不耐受。因此在诊断过程中可能引起症状复发或者无法准确诊断。