尖锐湿疣好发生于性活跃的青中年，潜伏期为 1～8 个月，平均 3 个月。外生殖器及肛门周围的皮肤粘膜湿润区为好发部位，男性多见于包皮、系带、冠状沟、龟头、尿道口、阴茎体、和阴囊，男同性恋者多见于肛门及直肠内。女性多见于大小阴唇、后联合、前庭、阴蒂、宫颈和肛周。偶可见于阴部及肛周以外的部位，如腋窝、脐窝、口腔、乳房和趾间等。

女性阴道炎和男性包皮过长是尖锐湿疣发生的促进因素。损害初期为细小淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起。红色或污灰色。根部常有蒂，且易发生糜烂渗液，触之易出血。皮损裂缝间常有脓性分泌物郁积，致有恶臭，且可因搔抓而引起继发感染。多数病人常无明显自觉症状，部分病人可出现异物感、痛、痒感或性交痛。

直肠内尖锐湿疣可发生疼痛、便血、里急后重感。宫颈部位疣体通常较小，界限清，表面光滑或呈颗粒状、沟回状，妊娠时可明显增大增多。少数病人可表现为潜伏感染或亚临床感染，前者局部皮肤粘膜外观正常且醋酸白试验阴性，但通过分子生物学方法可检到 HPV 的存在；后者指 HPV 感染后在临床上肉眼不能辨认，但以醋酸白试验（用 5%醋酸溶液涂抹或湿敷后发现局部发白）、组织病理或核酸检测技术能够发现 HPV 感染的证据。