功能性消化不良是否能自愈需要根据患者的具体情况而定，对于症状较轻的，通常可自愈。对于症状较重的，则通常需要在医生的指导下用药物治疗。

1.症状较轻：若功能性消化不良病情比较轻，可以自愈。这主要依赖于患者改变生活习惯，如少吃多餐，避免暴饮暴食，以及避免油腻、油炸等刺激性食物的摄入。

2.症状较重：若功能性消化不良病情比较严重，则会发生器质性病变，如引起慢性胃炎、胃食管反流等，出现明显的腹胀、反酸、嗳气、恶心等不适症状，这种情况下，无法自愈，患者也需要在医生的指导下使用药物进行治疗。

综上所述，功能性消化不良能否自愈取决于病情的严重程度和治疗的有效性，如果症状长时间无法缓解，建议咨询专业医生，进行规范的检查，对症治疗。