隐孢子虫病是一种由水源性传染病引起的疾病，主要影响免疫功能低下的人群和儿童。这种疾病可以导致长期腹泻、营养不良和生长发育迟缓等问题。近年来，随着分子生物学技术的发展，人们对隐孢子虫的流行病学、诊断、治疗和疫苗研究有了更深入的了解。

在流行病学方面，隐孢子虫病的全球负担正在增加，特别是在儿童和免疫功能低下或营养不良的人群中。隐孢子虫感染与亚急性死亡有关系，需要更详细的研究来阐释其发病机制和健康影响。使用先进的分子生物学方法进行纵向研究对阐释感染的发病机制、宿主和环境因素在易感性、免疫应答和临床预后中的作用具有关键作用。

在诊断方面，快速诊断隐孢子虫感染具有挑战性，特别是在资源匮乏的地区。显微镜和抗原检测方法对在种属水平上进行临床诊断有益。种类辨别和基因分型对疾病爆发的调查、流行病学、疾病负担评估和风险因素和传播研究有重要作用，最终可能有助于确定临床诊断。

在治疗方面，研发治疗隐孢子虫病的药物存在许多困难，包括如何在体外繁殖这些微生物。新型的体外方法可确保隐孢子虫繁殖，并可能有助于改善体外筛查新型治疗和疫苗。用于药物评估的动物模型缺乏标准化，且与人群中反应相关的目标反应未清晰定义。

在疫苗研究方面，虽然我们有理由乐观地看待预防隐孢子虫感染疫苗的发展，但是仍存在许多障碍，包括对人类保护性免疫反应了解不多，包括哪种抗原是关键的，哪种应答与保护性免疫相关以及哪种给药途径是最优的。这些困境可通过一个资助较多的疫苗发展计划来解决，而这个疫苗发展计划应有清晰的成功标准。