肠胃不适发烧的治疗方法主要根据发烧的原因和症状来制定，通常可以采取药物治疗，一般治疗等治疗方法。

1.细菌性胃肠炎引起的发烧：多数是不当饮食引起，如食用不洁、生冷等刺激性的食物会导致发生细菌性胃肠炎。一般表现为恶心、呕吐、腹泻，还可能会伴随发热、脱水等症状。这时可以用抗生素治疗，如左氧氟沙星，一般急性胃肠炎缓解后，发热症状也会逐渐消退。如果高烧，则需先予以退烧药物，再进行其他治疗，如吲哚美辛。

2.病毒性胃肠炎引起的发烧：由病毒感染引起的急性胃肠炎症，发病症状多表现为腹痛、腹泻、水样便、恶心、呕吐、发烧等。一般需要对因、对症治疗，可以使用蒙脱石散抑制病毒、缓解腹泻，腹泻严重时还需要补液治疗。

此外，在发烧期间，可能会出现食欲不振，可以选择易于消化的食物，如面条、稀饭、面包、鸡蛋等，避免油腻、辛辣和刺激性食物。因此，如果出现肠胃不适并伴有发烧的症状时，应及时就医，以免延误病情。